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V-Modul 419: Grundlagen der Genomanalyse
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Praktikum (2 Wochen ganztägig, 04.07.2011 - 15.07.2011)
| 09:15 - 10.00 | Vorlesung Dr. Dagan (Methoden, auf Englisch) |
| 10:15 - 11:00 | Vorlesung Prof. Dr. Martin (Theorie) |
| 11:00 - | Übungen (im Rechenzentrum) |
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Bitte beachten Sie, dass die Vorlesung montags und dienstags in Hörsaal 6E statt findet, mittwochs bis freitags jedoch in 6F. Im Rechenzentrum ist jeweils anschließend Raum 00.41 reserviert.
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Die Klausur findet am letzten Praktikumstag statt!
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Prof. Dr. Martin und Dr. Dagan (Leitung)
Fragen und Kommentare bitte an Mayo Röttger
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Studierende sollen den selbständigen Umgang mit molekularen Sequenzen in
einer Unix-Umgebung lernen. Absolventen des Praktikums sollen am Ende mit den wichtigsten biologischen Datenbanken vertraut sein sowie mit
den gängigsten Methoden, die dort enthaltene Information lokal zu
verarbeiten. Es wird fast ausschließlich mit kommandozeilen-orientierten
Programmen wie emboss,
phylip und
clustal w gearbeitet, es
werden aber keine praktischen Vorkenntnisse bzgl. des Umgangs in
UNIX-Umgebungen vorausgesetzt. Nach einer kurzen Einführung und unter
ständiger Betreuung versuchen Studierende durch das Durcharbeiten des sehr
ausführlichen Skriptes einzeln am PC-Arbeitsplatz unter Linux die
Algorithmen zu verstehen und das Erlernte durch das konkrete Lösen der
Übungsaufgaben umzusetzen.
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Veranstaltungshäufigkeit und Teilnehmerzahl
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Sommersemester, 67 Praktikumsplätze
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Vordiplom, Zentrale Platzvergabe
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